На екологічному стані міських лісів негативно позначилось відведення значних площ відомствам та установам у постійне або довгострокове користування здебільшого з вилученням першокласних деревостоїв з державного лісового фонду‚ що фактично призвело до припинення на таких ділянках ведення лісового господарства‚ лісозахисних та санітарних заходів. Лише на території Голосіївського лісництва ЛПГ "Конча-Заспа" знаходиться біля 20 лісокористувачів‚ а загальний розмір відданого лісу становить понад 800 га‚ тобто сягнув 79 % нинішньої території лісництва. Часто відомства - лісокористувачі продовжують утримувати лісопокриті площі після закінчення дії договору цільового надання площ. Нині‚ у зв`язку з процесами приватизації‚ різко посилилися намагання підприємств і організацій перевести тимчасово наданий ліс у постійне користування з вилученням лісостанів з державного лісового фонду України.

На деяких перевірених заповідних територіях  виявлені порушення заповідного режиму , зокрема, парках – пам`ятках садово-паркового мистецтва: Голосіївський парк ім. М.Рильського, "Нивки", Святошинський лісопарк, лісопарк Пуща-Водиця; заказник "Лісники". Вони полягають у залишенні на ділянках сухостійних або дерев, що всихають, забудові без відповідних погоджень заповідних територій, самовільних рубок, засміченні парків побутовими відходами.

Загрозливих масштабів набули несанкціоновані стихійні звалища побутового та будівельного сміття. Особливо в районах з приватною забудовою (Сирецький гай, Голосіївський ліс, Феофанія, Дарницьке та Святошинське ЛПГ).